14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2027 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2027  metallophosphoesterase  100 
 
 
595 aa  1227    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2486  metallophosphoesterase  46.6 
 
 
586 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.907019  normal  0.296957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1468  metallophosphoesterase  46.03 
 
 
804 aa  472  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2026  metallophosphoesterase  44.8 
 
 
719 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5249  metallophosphoesterase  44.97 
 
 
659 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0905  twin-arginine translocation pathway signal  45.53 
 
 
662 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.486466  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2905  metallophosphoesterase  46.75 
 
 
593 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0794  twin-arginine translocation pathway signal  43.92 
 
 
659 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1179  geranylgeranylglyceryl phosphate synthase family protein  39.93 
 
 
506 aa  353  7e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.6021  normal  0.228569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3235  metallophosphoesterase  28.13 
 
 
499 aa  147  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4124  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
554 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2843  metallophosphoesterase  22.47 
 
 
527 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00214985  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1384  metallophosphoesterase  23.8 
 
 
546 aa  62.4  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
270 aa  48.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>