56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0198 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0198  ferredoxin family protein, putative  100 
 
 
64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3697  ferredoxin family protein, putative  82.81 
 
 
64 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70.31 
 
 
64 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  68.25 
 
 
63 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  66.67 
 
 
63 aa  97.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.19 
 
 
64 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0848  ferredoxin family protein, putative  66.13 
 
 
73 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3492  ferredoxin family protein, putative  68.25 
 
 
73 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  60.94 
 
 
317 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1093  ferredoxin family protein, putative  57.81 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3169  ferredoxin family protein, putative  57.81 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  57.81 
 
 
63 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  58.06 
 
 
62 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  54.84 
 
 
62 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  60.32 
 
 
63 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  53.97 
 
 
62 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  53.97 
 
 
62 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  57.14 
 
 
63 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  46.15 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  46.88 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.54 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  45.31 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.06 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.77 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.08 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  43.75 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15971  ferredoxin  40.98 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16791  hypothetical protein  42.19 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0839  Ferredoxin-like protein  37.7 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00930022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1897  ferredoxin  39.34 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2578  hypothetical protein  40.98 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390984  normal  0.110309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2579  ferredoxin  37.7 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.77 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.37 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16571  hypothetical protein  38.1 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.262713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1921  Ferredoxin-like protein  37.7 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.207385  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1749  ferredoxin  37.7 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.855381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0286  ferredoxin II  41.27 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9697  predicted protein  37.7 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.012492  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  39.34 
 
 
349 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1570  hypothetical protein  40.98 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2655  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.33 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1007  ferredoxin  37.7 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18761  hypothetical protein  37.7 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0615  3Fe-4S ferredoxin  36.07 
 
 
92 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.27 
 
 
68 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 
60 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 
60 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  40.98 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  40.98 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2647  ferredoxin  37.7 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668061  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5089  ferredoxin  37.7 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.536243  normal  0.0695219 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 
60 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0107  ferredoxin  36.07 
 
 
151 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.8941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  39.34 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>