55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2747 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  99.8 
 
 		 1068 bp  1943    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  99.9 
 
 		 993 bp  1951    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  99.9 
 
 		 993 bp  1951    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0676    99.86 
 
 		 1031 bp  1360    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  99.7 
 
 		 1047 bp  1935    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  99.9 
 
 		 993 bp  1951    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2676    99.7 
 
 		 672 bp  1306    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  0.345661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  100 
 
 		 993 bp  1959    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2747    100 
 
 		 1062 bp  2105    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0487379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  99.9 
 
 		 993 bp  1951    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    88.65 
 
 		 2579 bp  153  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2536    92.16 
 
 		 950 bp  139  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 990 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 951 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 951 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 984 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 951 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 951 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 990 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 951 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 951 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 951 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  87.23 
 
 		 951 bp  137  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  87.88 
 
 		 966 bp  135  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  87.5 
 
 		 387 bp  127  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    87.5 
 
 		 980 bp  127  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0371  hypothetical protein  87.85 
 
 		 252 bp  109  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  84.67 
 
 		 594 bp  105  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 		 960 bp  103  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 		 960 bp  103  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  92.11 
 
 		 960 bp  103  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  92.11 
 
 		 513 bp  103  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  92.11 
 
 		 960 bp  103  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  88.3 
 
 		 1392 bp  99.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  83.33 
 
 		 834 bp  91.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  89.61 
 
 		 462 bp  89.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  89.61 
 
 		 990 bp  89.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  89.61 
 
 		 861 bp  89.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  84.55 
 
 		 567 bp  83.8  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  92.86 
 
 		 798 bp  79.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  92.45 
 
 		 252 bp  73.8  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1157    80 
 
 		 396 bp  69.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4242    84.04 
 
 		 306 bp  67.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662233  normal  0.0765 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  84.44 
 
 		 912 bp  67.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5272    88.52 
 
 		 630 bp  65.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  87.3 
 
 		 843 bp  61.9  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1101  putative transposase  81.82 
 
 		 162 bp  60  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2999    90.91 
 
 		 405 bp  56  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  100 
 
 		 558 bp  56  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0781  transposase (class I)  87.27 
 
 		 366 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  79.85 
 
 		 666 bp  52  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2630    93.75 
 
 		 225 bp  48.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2570    88.64 
 
 		 66 bp  48.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  100 
 
 		 966 bp  48.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0143  hypothetical protein  82.5 
 
 		 129 bp  48.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>