40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1573 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  100 
 
 
92 aa  184  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  73.81 
 
 
107 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  67.86 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  59.04 
 
 
95 aa  103  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  60.76 
 
 
94 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  60.76 
 
 
94 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  56.96 
 
 
97 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  59.49 
 
 
94 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  53.49 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  51.76 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  51.81 
 
 
95 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  52.69 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  52.69 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  47.25 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  49.4 
 
 
97 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  51.16 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  54.12 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  52.38 
 
 
88 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  52.38 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  52.38 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  53.95 
 
 
108 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  53.75 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  55.26 
 
 
101 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  51.25 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  46.34 
 
 
88 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  51.9 
 
 
122 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  47.62 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  47.67 
 
 
126 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  42.86 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  47.5 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  47.37 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  52.86 
 
 
321 aa  74.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  43.9 
 
 
181 aa  73.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  55.38 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  48.05 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  44.16 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  40.79 
 
 
82 aa  60.1  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  44.78 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  41.1 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  36.62 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>