14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1505 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1505  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  869    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.335604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1689  polysaccharide biosynthesis protein  33.68 
 
 
452 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02859  predicted inner membrane protein  24.55 
 
 
449 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 
452 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3450  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
449 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3268  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 
449 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.809539  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3163  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 
449 aa  108  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0710  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 
449 aa  107  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2493  polysaccharide biosynthesis protein  30.79 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0697139  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6369  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02808  hypothetical protein  25.48 
 
 
355 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000016091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0713  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 
355 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2610  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151394 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  19.63 
 
 
418 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>