47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4848 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  45.28 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  46.74 
 
 		 272 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  48.03 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  45.66 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  45.66 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  45.66 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  46.06 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  46.91 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  42.81 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  43.82 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  45.93 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  42.06 
 
 		 285 aa  188  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  42.08 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  42.44 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  42.44 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  42.44 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  39.1 
 
 		 319 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  38.36 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  33.97 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  32.7 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  32.38 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  30.43 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  29.46 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  30.62 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  28.14 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  28.57 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  29.19 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1496  Protein of unknown function DUF2236  35.66 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  25.84 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  26.13 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  25.68 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  23.6 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  23.17 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  28.92 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  26.4 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  30 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  25.21 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03292  hypothetical protein  31.68 
 
 		 111 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00451567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  25.85 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  27.01 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  25.28 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  30.09 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  28.93 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  24.76 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>