22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4575 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  876    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  45.43 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  44.57 
 
 		 503 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  46.18 
 
 		 300 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  46.18 
 
 		 300 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  41.25 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  36.89 
 
 		 701 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  36.89 
 
 		 701 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  36.89 
 
 		 701 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  37.13 
 
 		 692 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1576  hypothetical protein  35.98 
 
 		 676 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.592889  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  39.47 
 
 		 606 aa  210  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  35.8 
 
 		 328 aa  200  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  34.65 
 
 		 676 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  34.65 
 
 		 676 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  34.65 
 
 		 680 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  33.72 
 
 		 502 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  29.77 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  28.22 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2260  hypothetical protein  29.14 
 
 		 368 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.39109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0109  hypothetical protein  29.63 
 
 		 797 aa  46.6  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>