40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4125 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 201 aa  411  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  34.62 
 
 		 514 aa  71.6  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.6 
 
 		 470 aa  68.6  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.59 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0040  hypothetical protein  35.71 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  33.08 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2989  hypothetical protein  33.91 
 
 		 482 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3238  hypothetical protein  33.91 
 
 		 481 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  61.6  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.41368e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3002  hypothetical protein  33.93 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0878761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3232  hypothetical protein  33.93 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3259  hypothetical protein  33.93 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3256  hypothetical protein  33.93 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.218487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2927  hypothetical protein  33.93 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3224  hypothetical protein  33.04 
 
 		 498 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2030  hypothetical protein  31.62 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.533222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.27 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2947  hypothetical protein  31.58 
 
 		 481 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0687281  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.15 
 
 		 492 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.58 
 
 		 866 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.73 
 
 		 398 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.19 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.97 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.34 
 
 		 397 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  28.37 
 
 		 411 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.09 
 
 		 257 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  26.28 
 
 		 408 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.17 
 
 		 541 aa  45.4  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.914763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.57 
 
 		 370 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.01 
 
 		 559 aa  45.1  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.5 
 
 		 376 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  24.43 
 
 		 493 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.93 
 
 		 303 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  22.22 
 
 		 568 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.57 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  28.16 
 
 		 507 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.71 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  22.14 
 
 		 503 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  26.15 
 
 		 418 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>