25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2850 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  55.56 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  40.38 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  51.52 
 
 		 81 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  48.48 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  46.15 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  51.56 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  36.14 
 
 		 280 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  46.43 
 
 		 288 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  47.27 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  49.09 
 
 		 270 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  45.45 
 
 		 272 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  45.45 
 
 		 291 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  40 
 
 		 290 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  44.64 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  46.43 
 
 		 284 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  43.64 
 
 		 272 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  43.64 
 
 		 275 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  36 
 
 		 307 aa  42  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  41.82 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  41.82 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  41.82 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  32.5 
 
 		 279 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>