29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2514 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2514  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 149 aa  297  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2545  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  61.42 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2708  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.01 
 
 		 179 aa  120  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.826826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0106  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  48.76 
 
 		 209 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5359  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.6 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2611  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.8 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.132011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0342  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  43.9 
 
 		 190 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0352  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  43.9 
 
 		 229 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0331  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  43.9 
 
 		 206 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26850  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  49.19 
 
 		 228 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.405147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6027  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.34 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.350512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4520  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  44.93 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07970  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  50 
 
 		 291 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131897  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1418  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44 
 
 		 195 aa  103  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2177  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.18 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148812  normal  0.0743485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2293  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.66 
 
 		 303 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1423  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.81 
 
 		 237 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0104  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.55 
 
 		 196 aa  87  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2154  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40 
 
 		 286 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119345  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.63 
 
 		 448 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  33.33 
 
 		 269 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18330  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  36.92 
 
 		 357 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.56 
 
 		 264 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.81 
 
 		 244 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  32.98 
 
 		 250 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  27.88 
 
 		 236 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  32.69 
 
 		 243 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.27 
 
 		 239 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.27 
 
 		 243 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>