273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1542 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1542  arsenate reductase  100 
 
 		 113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4784  arsenate reductase  65.49 
 
 		 113 aa  154  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.375449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  62.83 
 
 		 113 aa  148  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  62.16 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  62.16 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  62.16 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1942  arsenate reductase  62.16 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  50.43 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  49.57 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  49.57 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  48.7 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  50.43 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  47.83 
 
 		 141 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  49.57 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  49.57 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  48.7 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_004310  BR0989  arsenate reductase ArsC, putative  46.96 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  46.96 
 
 		 152 aa  114  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  50.43 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  52.17 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  46.61 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  49.12 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0957  arsenate reductase  46.96 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  50.43 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  47.83 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  47.83 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  50.43 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  47.83 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  54.63 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  44.35 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  50.45 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  46.96 
 
 		 141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  44.35 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  49.11 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  46.96 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  49.12 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  49.12 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  46.09 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  49.12 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  49.12 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  49.12 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  46.96 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  49.12 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  45.22 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  48.7 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  49.12 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  46.49 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  49.12 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0718  arsenate reductase  49.12 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0377236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  46.09 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4257  arsenate reductase  48.25 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.339282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  46.96 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  49.11 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2198  arsenate reductase  46.79 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  50.43 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  47.32 
 
 		 116 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  46.09 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  45.22 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  47.32 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3795  arsenate reductase  48.25 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  49.11 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  46.49 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  49.12 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  47.32 
 
 		 118 aa  105  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  47.32 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2243  arsenate reductase  46.09 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3279  arsenate reductase  46.9 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107432  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2798  arsenate reductase and related  48.7 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  46.9 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4072  arsenate reductase  50.43 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124746  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  46.49 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  44.35 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  47.32 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  45.87 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  48.25 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  45.22 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  44.35 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  48.18 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  42.98 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  50 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.662339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  45.22 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3127  putative arsenate reductase  50.89 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  44.35 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  42.61 
 
 		 317 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  45.95 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3857  arsenate reductase  50 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  44.64 
 
 		 276 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  45.54 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  46.43 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  45.22 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  44.83 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  44.35 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1283  arsenate reductase  46.43 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.884735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  43.48 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  43.48 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  45.22 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  43.97 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2389  arsenate reductase  44.74 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  46.96 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  43.48 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>