16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1384 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  38.1 
 
 
282 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  35.96 
 
 
133 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  31.79 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  35.85 
 
 
172 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  31.95 
 
 
181 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2652  hypothetical protein  30.89 
 
 
924 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  39.24 
 
 
144 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.71 
 
 
438 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  46 
 
 
105 aa  45.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3808  hypothetical protein  34.91 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176613  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  35 
 
 
160 aa  45.1  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2859  hypothetical protein  42.67 
 
 
146 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  42.67 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00580  hypothetical protein  34.67 
 
 
136 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0242  hypothetical protein  38.64 
 
 
339 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>