46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1211 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 282 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  42.6 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  41.67 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  37.5 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  41.03 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  39.86 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  39.09 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  38.49 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  39.53 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  36.76 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  38.76 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  43.17 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  38.25 
 
 		 343 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  38.25 
 
 		 343 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  38.4 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  38.82 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  38.82 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  38.82 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  36.59 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  32.03 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  31.05 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  29.65 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  30.08 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  29.89 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  27.95 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  28.77 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5273  hypothetical protein  31.66 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1496  Protein of unknown function DUF2236  27.39 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  25.64 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  27.81 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  23.75 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0968  hypothetical protein  30.15 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  24.65 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  24.3 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  27.08 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  29.92 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  25.48 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  33.04 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  33.04 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  33.04 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0739  hypothetical protein  27.23 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845921  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  25.37 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  26.49 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  26.16 
 
 		 279 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>