160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3389 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0857  aminoacyl-histidine dipeptidase  91.53 
 
 		 484 aa  854    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3389  aminoacyl-histidine dipeptidase  100 
 
 		 484 aa  983    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00176848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0537  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.35 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1680  Pep581 peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M20C  47.01 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0945346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1584  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.07 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1142  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.57 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1387  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.61 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0727929  unclonable  0.0000123065 
 
 
-
 
NC_002950  PG0137  aminoacyl-histidine dipeptidase  42.24 
 
 		 484 aa  395  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.49846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0525  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  43.45 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1504  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  44.05 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004273  aminoacyl-histidine dipeptidase (Peptidase D)  41.63 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2400  aminoacyl-histidine dipeptidase  43.18 
 
 		 486 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1869  aminoacyl-histidine dipeptidase  42.35 
 
 		 534 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.550605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1744  aminoacyl-histidine dipeptidase  43.15 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129269 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12668  aminoacyl-histidine dipeptidase  42.17 
 
 		 487 aa  391  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0895  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.63 
 
 		 486 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3290  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.84 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2403  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.58 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2852  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.21 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.017395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01157  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.42 
 
 		 490 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1720  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  44.19 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0973  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.07 
 
 		 484 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2115  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.37 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0963  aminoacyl-histidine dipeptidase  42.05 
 
 		 486 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0180  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.88 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1011  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  41.21 
 
 		 486 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.855655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2957  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  43.87 
 
 		 487 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.974491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0962  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.5 
 
 		 487 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1222  aminoacyl-histidine dipeptidase  43.53 
 
 		 486 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.000871052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3156  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.21 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3091  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.84 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3295  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.42 
 
 		 486 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00232  aminoacyl-histidine dipeptidase (peptidase D)  41.54 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3437  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.63 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00235  hypothetical protein  41.54 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0282  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.54 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.447065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0365  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.63 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0264  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.54 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0269  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.54 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3421  Xaa-His dipeptidase  40.71 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.11643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3307  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.21 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00393893  hitchhiker  0.00000164378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3344  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.54 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0291  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.54 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0453943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3603  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.5 
 
 		 497 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.905731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0928  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.75 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0234  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.54 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3370  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.54 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0357  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.42 
 
 		 485 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000446766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1115  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.5 
 
 		 486 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2053  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.63 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0350  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.42 
 
 		 485 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0355  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.42 
 
 		 485 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0954  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.29 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0173315  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0346  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.42 
 
 		 485 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0296229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0948  M20C family Xaa-His dipeptidase  40.08 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0986  M20C family Xaa-His dipeptidase  40.08 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2519  Xaa-His dipeptidase  40.29 
 
 		 486 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0940  aminoacyl-histidine dipeptidase  39.87 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.282545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3547  aminoacyl-histidine dipeptidase  39.87 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1798  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.11 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0950  M20C family Xaa-His dipeptidase  40.08 
 
 		 487 aa  364  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.478343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3422  aminoacyl-histidine dipeptidase  39.87 
 
 		 486 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3350  aminoacyl-histidine dipeptidase  39.87 
 
 		 486 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0763  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.66 
 
 		 485 aa  362  7.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62172  normal  0.0792119 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2079  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  46.11 
 
 		 484 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1877  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.7 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.326174  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1035  aminoacyl-histidine dipeptidase  42.39 
 
 		 485 aa  356  5.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2364  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.17 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.043104 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2361  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.73 
 
 		 490 aa  352  8.999999999999999e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1800  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.73 
 
 		 489 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2319  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.8 
 
 		 489 aa  349  8e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2498  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.8 
 
 		 489 aa  349  8e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2514  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.8 
 
 		 489 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.411549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2284  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.8 
 
 		 489 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00268357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2888  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.35 
 
 		 489 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120289  normal  0.458811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2587  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.8 
 
 		 489 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2240  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.59 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0840688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2447  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.38 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2527  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.38 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3039  aminoacyl-histidine dipeptidase  39.15 
 
 		 506 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000107892  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2301  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.38 
 
 		 489 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.280973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0894  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.58 
 
 		 485 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.011645  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2228  aminoacyl-histidine dipeptidase, putative  37.29 
 
 		 481 aa  323  3e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0004  M20C family Xaa-His dipeptidase  37.4 
 
 		 486 aa  317  4e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2963  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.08 
 
 		 487 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000053786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2796  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.59 
 
 		 486 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000441457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3149  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.91 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.35499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2706  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.21 
 
 		 479 aa  313  4.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.291599  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2512  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.61 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0316  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.38 
 
 		 471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2216  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.2 
 
 		 483 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0150704  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0516  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.6 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0622  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.19 
 
 		 476 aa  282  8.000000000000001e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.155688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3432  aminoacyl-histidine dipeptidase  30.5 
 
 		 487 aa  223  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00107226  hitchhiker  0.000115392 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1343  Xaa-His dipeptidase  32.53 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1073  aminoacyl-histidine dipeptidase  31.72 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11078  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0562  aminoacyl-histidine dipeptidase  30.28 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0809  aminoacyl-histidine dipeptidase  30.34 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.697451  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0999  aminoacyl-histidine dipeptidase  30.13 
 
 		 422 aa  169  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.738378  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1062  aminoacyl-histidine dipeptidase  29.7 
 
 		 422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>