17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3128 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 90 aa  184  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  97.78 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1954  type IV pilus assembly PilZ  60.92 
 
 		 93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  43.18 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  31.4 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  34.88 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  34.09 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  28.24 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  28.24 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0312  hypothetical protein  41.94 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  26.51 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0577  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  27.91 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  30.34 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  32 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1928  type IV pilus assembly PilZ  31.71 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>