230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1244 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
177 aa  370  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1363  acetyltransferase  32.32 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.014486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  31.71 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4788  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
173 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5108  acetyltransferase, gnat family  32.74 
 
 
173 aa  100  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
168 aa  94.7  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  28.95 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1761  acetyltransferase  29.41 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
169 aa  92  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  28.67 
 
 
176 aa  92  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  27.81 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1508  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.882533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0994  acetyltransferase  31.95 
 
 
167 aa  87  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.55 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.561407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4884  GCN5-related N-acetyltransferase  24.54 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0489648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15187  normal  0.614512 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1311  acetyltransferase  25.97 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1183  acetyltransferase  23.03 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000821591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0546  acetyltransferase  25.32 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  unclonable  9.485090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0985  acetyltransferase  26.62 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.188436  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1014  acetyltransferase  23.64 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000248844  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  21.43 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0938  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000016136  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1497  GCN5-related N-acetyltransferase  23.49 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  25.33 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0152  hypothetical protein  25.68 
 
 
166 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1376  acetyltransferase  25.31 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06590  acetyltransferase (GNAT) family protein  23.03 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0950  GCN5-related N-acetyltransferase  26.89 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  23.53 
 
 
365 aa  54.7  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06852  hypothetical protein  25.97 
 
 
166 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
175 aa  54.7  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  22.93 
 
 
163 aa  54.3  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000829593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0348  GCN5-related N-acetyltransferase  24.54 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000810741  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2485  acetyltransferase  23.39 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  23.68 
 
 
194 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.650543  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0971  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
157 aa  51.6  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0054  acetyltransferase  30.43 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.45 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1754  acetyltransferase  26.47 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  41.18 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.502613  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0857  acetyltransferase  26.47 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1146  acetyltransferase  26.47 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0401  acetyltransferase  26.47 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0312  acetyltransferase  26.47 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2121  acetyltransferase  26.47 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1853  acetyltransferase  27.78 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0961913  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3192  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
262 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  34.02 
 
 
173 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.4 
 
 
520 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.2 
 
 
530 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4930  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.58 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0032  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
160 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
148 aa  48.5  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5375  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173903  normal  0.430814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1307  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
184 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1301  acetyltransferase  32.76 
 
 
189 aa  47.8  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681894  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3325  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.03 
 
 
147 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0561  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4776  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
159 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0706  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
109 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2170  acetyltransferase  38.03 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  24.36 
 
 
178 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2004  acetyltransferase, GNAT family  30.3 
 
 
142 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5365  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1550  acetyltransferase  21.48 
 
 
173 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000469847  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5495  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00452023  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
142 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
151 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.694453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
364 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1376  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000841135  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000877  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  23.23 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929276  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4829  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5104  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
262 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5175  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
262 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.0185711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.17 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588882  normal  0.610129 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
198 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277179  normal  0.0503252 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3275  acetyltransferase  30.36 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  23.81 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  23.89 
 
 
229 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0161  GCN5-related N-acetyltransferase  36.92 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.115701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
291 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0736  acetyltransferase  25.96 
 
 
110 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0112815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2291  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101571  normal  0.149434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688854  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1285  GCN5-related N-acetyltransferase  20 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>