More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0954 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  100 
 
 		 214 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  96.26 
 
 		 214 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  68.54 
 
 		 217 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  65.57 
 
 		 216 aa  285  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  63.08 
 
 		 217 aa  279  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  61.46 
 
 		 220 aa  268  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  62.98 
 
 		 222 aa  266  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  59.91 
 
 		 214 aa  265  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  58.69 
 
 		 213 aa  264  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  58.22 
 
 		 214 aa  264  7e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  57.69 
 
 		 216 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  58.49 
 
 		 213 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  57.28 
 
 		 215 aa  254  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  54.46 
 
 		 213 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  56.25 
 
 		 216 aa  251  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  55.4 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  55.4 
 
 		 217 aa  250  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  56.25 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  56.25 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  56.25 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  56.13 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  56.25 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  56.94 
 
 		 216 aa  246  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  56.94 
 
 		 216 aa  246  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  56.94 
 
 		 216 aa  246  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  56.94 
 
 		 216 aa  246  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  56.94 
 
 		 216 aa  246  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  55.77 
 
 		 216 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  55.29 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  55.66 
 
 		 217 aa  241  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  53.05 
 
 		 217 aa  241  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  51.42 
 
 		 214 aa  241  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  54.67 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  50.24 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  56.37 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  50.24 
 
 		 215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  54.67 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  50.24 
 
 		 215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  55.14 
 
 		 217 aa  237  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  54.31 
 
 		 217 aa  237  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  51.4 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  53.99 
 
 		 217 aa  236  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  52.45 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  52.36 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  52.8 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  53.3 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  51.89 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  52.07 
 
 		 214 aa  231  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  51.89 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  50.92 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  51.79 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  52.11 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  52.83 
 
 		 214 aa  228  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  51.96 
 
 		 423 aa  228  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  50.92 
 
 		 215 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  47.17 
 
 		 217 aa  228  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  52.53 
 
 		 213 aa  228  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  227  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  51.38 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  52.79 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  50.45 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  50.23 
 
 		 217 aa  224  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  52.38 
 
 		 219 aa  224  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  224  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  50.22 
 
 		 221 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  50 
 
 		 217 aa  224  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  50.89 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  49.78 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  51.83 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  50.49 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  51.66 
 
 		 215 aa  221  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  50.71 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  50 
 
 		 217 aa  221  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  49.33 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  52.63 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  52.15 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  49.77 
 
 		 215 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  50 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  51.36 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  50 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  49.09 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  50.24 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  47.75 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  49.07 
 
 		 217 aa  218  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3567  adenylate kinase  50.45 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00563334  normal  0.0126858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  50 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  49.55 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  52.38 
 
 		 216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>