54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2489 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.35 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.75 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  48.75 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.75 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.24 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  44.3 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45 
 
 		 80 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  38.57 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.5 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  42.86 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  42.86 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  42.86 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  42.86 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  42.86 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  42.86 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.86 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  42.86 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.11 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.9 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3251  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.71 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.79659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0428  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.75 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2066  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.25 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.68 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0264  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.44 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  38.98 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4270  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.84 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0902743  normal  0.118236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  40.68 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.98 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  38.98 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  38.98 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3056  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1108  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.49 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.29 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  37.7 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.9 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2509  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.76 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2889  transcriptional regulator, AbrB family  36.76 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0461439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.48 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0985  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.82 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0579  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.44 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4024  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.19 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.738162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1367  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.49 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3976  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4391  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5964  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2886  PemI family protein  31.58 
 
 		 83 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2506  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.58 
 
 		 83 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4011  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.47 
 
 		 83 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7280  SpoVT/AbrB-like cell growth regulatory protein  34.15 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3974  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.45 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0889  SpoVT/AbrB-like  32.79 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>