39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1620 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1620  adaptor protein  100 
 
 
226 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0765  adaptor protein  76.11 
 
 
228 aa  348  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0906  adaptor protein  58.15 
 
 
224 aa  260  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1311  adaptor protein  55.7 
 
 
227 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4097  adaptor protein  55.26 
 
 
227 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1349  adaptor protein  55.7 
 
 
227 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.281114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1087  adaptor protein  55.7 
 
 
227 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.730074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1111  adaptor protein  55.7 
 
 
227 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1244  adaptor protein  55.26 
 
 
227 aa  245  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1093  adaptor protein  55.26 
 
 
227 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1273  adaptor protein  55.26 
 
 
227 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1099  adaptor protein  54.08 
 
 
227 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1203  adaptor protein  54.59 
 
 
217 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1016  adaptor protein  33.33 
 
 
239 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000556878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0997  adaptor protein  33.33 
 
 
239 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0891253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0578  adaptor protein  34.03 
 
 
240 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.210236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1372  adaptor protein  30.13 
 
 
202 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000504302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1616  adaptor protein  30.13 
 
 
202 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000116418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1400  adaptor protein  30.13 
 
 
202 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1584  adaptor protein  30.13 
 
 
202 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3725299999999996e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1371  adaptor protein  30.13 
 
 
202 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1510  adaptor protein  30.13 
 
 
202 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000470165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1651  adaptor protein  30.13 
 
 
202 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000117003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1545  adaptor protein  30.13 
 
 
202 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00170142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1712  Negative regulator of genetic competence  28.94 
 
 
204 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1412  adaptor protein  29.69 
 
 
202 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000280861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3800  adaptor protein  29.26 
 
 
202 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000607064  hitchhiker  0.000000000000878856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4102  Negative regulator of genetic competence  30.36 
 
 
193 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000186936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1213  adaptor protein  27.95 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000472996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2184  adaptor protein  25.66 
 
 
196 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0568  adaptor protein  25.43 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0444  adaptor protein  25.88 
 
 
196 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1703  adaptor protein  28.22 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.732057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1976  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  23.18 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.724291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0085  negative regulator of genetic competence  28.63 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0139  adaptor protein  23.79 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0216  adaptor protein  25.1 
 
 
249 aa  62  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2566  Negative regulator of genetic competence  25.33 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1358  adaptor protein  21.46 
 
 
217 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00058732  normal  0.0135974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>