21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2985 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 
312 aa  614  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  73.63 
 
 
312 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  49.5 
 
 
321 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  47.73 
 
 
148 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0185  nucleoside recognition domain protein  48.41 
 
 
154 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  44.72 
 
 
143 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  27.49 
 
 
316 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  26.47 
 
 
325 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  27.61 
 
 
330 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  26.76 
 
 
353 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  24.92 
 
 
327 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  25.24 
 
 
341 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  24.82 
 
 
325 aa  90.1  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  26.2 
 
 
324 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  22.44 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  26.06 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  25 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0110  nucleoside recognition domain protein  32.59 
 
 
154 aa  77  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.350312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  28.81 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08280  nucleoside recognition domain protein  26.49 
 
 
152 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  31.96 
 
 
786 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>