38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1725 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1725  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 243 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1701  hypothetical protein  86.42 
 
 		 242 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.310269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1904  hypothetical protein  55.41 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1934  hypothetical protein  54.73 
 
 		 238 aa  254  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.84002e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1738  cytochrome c biogenesis protein  56.09 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1761  hypothetical protein  56.09 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000352618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1710  cytochrome c biogenesis protein  55.65 
 
 		 226 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00062962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1899  hypothetical protein  56.09 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000526898  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0198  hypothetical protein  56.33 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.604148  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0268  cytochrome c biogenesis protein  56.33 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0868  putative cytochrome c biogenesis protein  30.64 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.87484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3833  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.53 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2348  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.53 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.170382  hitchhiker  0.0013358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1213  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.43 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.37 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.37 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  28.37 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.37 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.37 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.37 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.31 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.91 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.91 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.98 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.56 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.68 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.68 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0753  putative cytochrome c-type biogenesis protein  26.09 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.117718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  26.4 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  25 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.36 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.85 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.68 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.87 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.09 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.79 
 
 		 253 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.84 
 
 		 258 aa  42  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.89 
 
 		 244 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>