30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2348 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3833  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 232 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2348  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 232 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.170382  hitchhiker  0.0013358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1213  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  94.76 
 
 		 234 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0868  putative cytochrome c biogenesis protein  46.67 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.87484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1725  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.53 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1904  hypothetical protein  29.28 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1761  hypothetical protein  29.78 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000352618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1738  cytochrome c biogenesis protein  29.78 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1710  cytochrome c biogenesis protein  29.33 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00062962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1899  hypothetical protein  29.78 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000526898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1934  hypothetical protein  29.33 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.84002e-47 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0198  hypothetical protein  27.43 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.604148  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0268  cytochrome c biogenesis protein  27.43 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1701  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.310269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.91 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.36 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1953  cytochrome c biogenesis protein  26.25 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.23 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.01 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.73 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  33.86 
 
 		 623 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  24.29 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.75 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.15 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.27 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.38 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.16 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.18 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.68 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  30.39 
 
 		 630 aa  42  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>