32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1213 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1213  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3833  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  94.76 
 
 		 232 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2348  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  94.76 
 
 		 232 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.170382  hitchhiker  0.0013358 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0868  putative cytochrome c biogenesis protein  44.89 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.87484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1725  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.43 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1904  hypothetical protein  31.36 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1761  hypothetical protein  31.39 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000352618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1934  hypothetical protein  30.94 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.84002e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1899  hypothetical protein  31.39 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000526898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1710  cytochrome c biogenesis protein  30.94 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00062962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1738  cytochrome c biogenesis protein  30.94 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0198  hypothetical protein  27.59 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.604148  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0268  cytochrome c biogenesis protein  27.59 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1701  hypothetical protein  29.46 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.310269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.45 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.57 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.23 
 
 		 245 aa  48.5  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1953  cytochrome c biogenesis protein  25.73 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.39 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.7 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  34.92 
 
 		 623 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.51 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.27 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.51 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.13 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  24.65 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.18 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.89 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  22.89 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.75 
 
 		 222 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.63 
 
 		 229 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.26 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>