30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1701 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1701  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  471  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.310269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1725  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  86.42 
 
 		 243 aa  424  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1904  hypothetical protein  55.26 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1934  hypothetical protein  56.85 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.84002e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1738  cytochrome c biogenesis protein  57.46 
 
 		 226 aa  255  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1761  hypothetical protein  57.46 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000352618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1899  hypothetical protein  57.46 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000526898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1710  cytochrome c biogenesis protein  57.89 
 
 		 226 aa  254  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00062962  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0268  cytochrome c biogenesis protein  57.33 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0198  hypothetical protein  57.33 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.604148  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0868  putative cytochrome c biogenesis protein  29.36 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.87484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3833  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.46 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1213  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.36 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2348  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.46 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.170382  hitchhiker  0.0013358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.77 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.51 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.49 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  26.44 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.55 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.43 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.11 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.46 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.83 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.35 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.32 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.35 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.35 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  28.35 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.35 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.35 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>