164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0551 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  79.79 
 
 		 470 aa  792    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  79.96 
 
 		 471 aa  805    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  79.32 
 
 		 472 aa  792    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  79.54 
 
 		 472 aa  796    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  79.54 
 
 		 472 aa  796    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  79.32 
 
 		 472 aa  792    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  79.54 
 
 		 472 aa  803    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  95.14 
 
 		 473 aa  917    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  79.58 
 
 		 470 aa  790    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  79.54 
 
 		 472 aa  795    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  79.75 
 
 		 470 aa  807    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  100 
 
 		 475 aa  984    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  78.9 
 
 		 471 aa  796    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  60.21 
 
 		 466 aa  588  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  58.02 
 
 		 485 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  57.14 
 
 		 470 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  59.43 
 
 		 416 aa  510  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  50 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  47.23 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  79.7 
 
 		 269 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  80 
 
 		 269 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  43.78 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  38.88 
 
 		 513 aa  350  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0858  stage V sporulation protein R, truncation  78.57 
 
 		 196 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  38.95 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0864  stage V sporulation protein R  78.57 
 
 		 196 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000203295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  38.48 
 
 		 507 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0862  stage V sporulation protein R  77.04 
 
 		 196 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000240989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  37.84 
 
 		 499 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  35.81 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  36.15 
 
 		 499 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  36.12 
 
 		 495 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  36.15 
 
 		 499 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  38.43 
 
 		 478 aa  309  8e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  36.25 
 
 		 467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  37.47 
 
 		 462 aa  292  7e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  36.73 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  36.52 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  36.11 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3906  SpoVR family protein  31.24 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  32.84 
 
 		 516 aa  210  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  31.36 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  30.82 
 
 		 532 aa  207  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  31.58 
 
 		 505 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  32.02 
 
 		 502 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  32.02 
 
 		 502 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  31.02 
 
 		 517 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  31.34 
 
 		 511 aa  206  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  31.29 
 
 		 511 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  31.29 
 
 		 511 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  30.58 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  31.38 
 
 		 520 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  30.48 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  31.86 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  30.9 
 
 		 508 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  30.19 
 
 		 508 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  30.19 
 
 		 508 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  31.71 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  30.31 
 
 		 508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  31.16 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  30.31 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  29.3 
 
 		 508 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  29.71 
 
 		 513 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  30.31 
 
 		 508 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  30.4 
 
 		 508 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1831  SpoVR family protein  30.1 
 
 		 510 aa  196  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  30.06 
 
 		 508 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  28.81 
 
 		 560 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  29.52 
 
 		 511 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  29.66 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  28.81 
 
 		 560 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  28.81 
 
 		 560 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  28.81 
 
 		 560 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  28.81 
 
 		 560 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  28.81 
 
 		 560 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  29.57 
 
 		 519 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1960  SpoVR family protein  28.12 
 
 		 504 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  30.94 
 
 		 510 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  31.21 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  31.21 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  31.21 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  31.21 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  29.24 
 
 		 522 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  31.21 
 
 		 510 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  28.29 
 
 		 538 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  29.79 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  28.11 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  27.75 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  28.81 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  29.79 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  29.3 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  30.39 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  30.39 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  30.6 
 
 		 510 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1227  SpoVR family protein  29.23 
 
 		 578 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  30.39 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  30.39 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2448  SpoVR family protein  29.68 
 
 		 506 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0619548  normal  0.114389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  29.79 
 
 		 522 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  30.39 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>