24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2978 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  169  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  63.75 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  48.05 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  49.35 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  43.75 
 
 		 83 aa  87  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  54.43 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  40 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  36.47 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  32.93 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2487  TRASH domain-containing protein  31.71 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1429  TRASH domain-containing protein  33.33 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0363  TRASH domain protein  29.76 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00964883 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1187  TRASH domain-containing protein  37.65 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  48.65 
 
 		 796 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 778 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  47.73 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 777 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 798 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  38.1 
 
 		 805 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  46.34 
 
 		 767 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  46.15 
 
 		 441 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  43.59 
 
 		 787 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 		 835 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1455  TRASH  31.33 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00129945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>