20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2461 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2461  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  87.25 
 
 
104 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0639  hypothetical protein  70.3 
 
 
104 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0582  hypothetical protein  64.36 
 
 
104 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000451193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0595  hypothetical protein  62.38 
 
 
104 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0392  hypothetical protein  59.6 
 
 
103 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000101925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0694  hypothetical protein  58.16 
 
 
103 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000327351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  48.61 
 
 
90 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  34.57 
 
 
101 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1763  hypothetical protein  52.94 
 
 
81 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.303633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  34.04 
 
 
94 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  46.3 
 
 
204 aa  49.7  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0385  hypothetical protein  44 
 
 
81 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  30.69 
 
 
114 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  34.83 
 
 
134 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  30.69 
 
 
114 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  30.69 
 
 
115 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>