17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2056 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2056  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  100 
 
 		 160 aa  320  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0635  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  43.31 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.5 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0330  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  34.06 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000018584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2457  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  36.43 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2215  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  33.93 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0131371  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1707  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  26.09 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3654  TRAP transporter DctQ family protein  28.99 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0333  hypothetical protein  24.79 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  29.77 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0647  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  29.46 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2288  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212485  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1732  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.19 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00171017  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0635  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  25 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0513  hypothetical protein  25.36 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1549  TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system small permease component-like protein  29.45 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  26.15 
 
 		 173 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>