20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1811 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1811  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1435  sporulation-related protein  49.46 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.419741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2303  sporulation domain-containing protein  43.28 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00342773  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  36.55 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1941  Sporulation domain protein  34.26 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1018  sporulation domain-containing protein  35.66 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0660774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1136  Sporulation domain protein  52.11 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  31.08 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  47.06 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3376  Sporulation domain protein  45.1 
 
 		 234 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  39.53 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  25.61 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  39.53 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3214  sporulation domain-containing protein  25.31 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  32.11 
 
 		 177 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  39.51 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  36.92 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  25.51 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.37 
 
 		 174 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  41.82 
 
 		 265 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>