16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0312 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0312  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  75 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  34.88 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3900  hypothetical protein  36.9 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.121911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  34.83 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1954  type IV pilus assembly PilZ  45.16 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  29.89 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  29.89 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  29.67 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  28.41 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  28.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0997  type IV pilus assembly PilZ  27.06 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  41.94 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  41.94 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  31.46 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>