18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0137 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0191  hypothetical protein  69.4 
 
 		 232 aa  335  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3936  type IV pilus assembly PilZ  48.48 
 
 		 235 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4020  type IV pilus assembly PilZ  48.05 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05995e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1967  type IV pilus assembly PilZ  39.91 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1679  type IV pilus assembly PilZ  34.45 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00152995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1878  type IV pilus assembly PilZ  35.38 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000011309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1040  type IV pilus assembly PilZ  34.47 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0356  type IV pilus assembly PilZ  31.47 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000798491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0376  type IV pilus assembly PilZ  31.47 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0403  type IV pilus assembly PilZ  27.03 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0929712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  27.86 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1281  type IV pilus assembly PilZ  25.31 
 
 		 629 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0122  type IV pilus assembly PilZ  26.11 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0984  type IV pilus assembly protein PilZ  26.48 
 
 		 360 aa  52.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0238  hypothetical protein  27.16 
 
 		 375 aa  52  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.282565  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1697  type IV pilus assembly protein PilZ  28.8 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00195007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>