11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1281 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1281  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
629 aa  1286    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0191  hypothetical protein  26.58 
 
 
232 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156505  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  25.31 
 
 
232 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3936  type IV pilus assembly PilZ  21.74 
 
 
235 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4020  type IV pilus assembly PilZ  21.26 
 
 
235 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05995e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0376  type IV pilus assembly PilZ  22.97 
 
 
238 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0356  type IV pilus assembly PilZ  23.43 
 
 
238 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000798491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  29.51 
 
 
417 aa  54.3  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1967  type IV pilus assembly PilZ  20.75 
 
 
234 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1040  type IV pilus assembly PilZ  22.09 
 
 
236 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0122  type IV pilus assembly PilZ  19.82 
 
 
378 aa  43.9  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>