19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0191 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0191  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  473  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  69.4 
 
 		 232 aa  335  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3936  type IV pilus assembly PilZ  50.65 
 
 		 235 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4020  type IV pilus assembly PilZ  50.22 
 
 		 235 aa  221  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05995e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1967  type IV pilus assembly PilZ  38.89 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1679  type IV pilus assembly PilZ  31.09 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00152995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0376  type IV pilus assembly PilZ  31.47 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1878  type IV pilus assembly PilZ  32.63 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000011309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0356  type IV pilus assembly PilZ  30.6 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000798491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1040  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0403  type IV pilus assembly PilZ  29.28 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0929712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  27.69 
 
 		 417 aa  82.4  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1281  type IV pilus assembly PilZ  26.58 
 
 		 629 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0122  type IV pilus assembly PilZ  25.62 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0238  hypothetical protein  30.77 
 
 		 375 aa  53.1  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.282565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0549  heme NO binding domain-containing protein  24.09 
 
 		 417 aa  48.5  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.197755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0984  type IV pilus assembly protein PilZ  24.5 
 
 		 360 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1192  type IV pilus assembly PilZ  21.98 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1697  type IV pilus assembly protein PilZ  26.83 
 
 		 360 aa  43.9  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00195007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>