13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0403 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0403  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
234 aa  481  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0929712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4020  type IV pilus assembly PilZ  32.67 
 
 
235 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05995e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3936  type IV pilus assembly PilZ  32.67 
 
 
235 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0191  hypothetical protein  29.28 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156505  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  27.03 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0356  type IV pilus assembly PilZ  29.35 
 
 
238 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000798491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1967  type IV pilus assembly PilZ  26.96 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1878  type IV pilus assembly PilZ  27.94 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000011309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1679  type IV pilus assembly PilZ  25.24 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00152995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0376  type IV pilus assembly PilZ  27.43 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1040  type IV pilus assembly PilZ  25.56 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0122  type IV pilus assembly PilZ  27.27 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  24.55 
 
 
417 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>