16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1878 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1878  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000011309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1679  type IV pilus assembly PilZ  55.32 
 
 		 237 aa  271  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00152995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  35.38 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0191  hypothetical protein  32.63 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4020  type IV pilus assembly PilZ  32.86 
 
 		 235 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05995e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3936  type IV pilus assembly PilZ  32.86 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1040  type IV pilus assembly PilZ  30.29 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1967  type IV pilus assembly PilZ  31.78 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0356  type IV pilus assembly PilZ  28.1 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000798491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0376  type IV pilus assembly PilZ  28.1 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0403  type IV pilus assembly PilZ  27.94 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0929712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  24.14 
 
 		 417 aa  58.9  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0122  type IV pilus assembly PilZ  24.63 
 
 		 378 aa  52  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1697  type IV pilus assembly protein PilZ  25 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00195007  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0984  type IV pilus assembly protein PilZ  25.33 
 
 		 360 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0238  hypothetical protein  24.34 
 
 		 375 aa  46.2  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.282565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>