13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0984 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0984  type IV pilus assembly protein PilZ  100 
 
 
360 aa  739    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1697  type IV pilus assembly protein PilZ  54.72 
 
 
360 aa  420  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00195007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0238  hypothetical protein  33.16 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.282565  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0122  type IV pilus assembly PilZ  34.84 
 
 
378 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3936  type IV pilus assembly PilZ  29.94 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1040  type IV pilus assembly PilZ  25.95 
 
 
236 aa  59.3  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4020  type IV pilus assembly PilZ  28.66 
 
 
235 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05995e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0376  type IV pilus assembly PilZ  29.08 
 
 
238 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  24.77 
 
 
417 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0356  type IV pilus assembly PilZ  28.37 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000798491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  27.23 
 
 
232 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0191  hypothetical protein  24.5 
 
 
232 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156505  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1878  type IV pilus assembly PilZ  25.33 
 
 
239 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000011309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>