23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3635 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  91.28 
 
 		 172 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  57.64 
 
 		 174 aa  187  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  53.46 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  59.85 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  41.96 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  38.06 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  43.24 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  33.55 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  34.65 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  36.28 
 
 		 364 aa  68.2  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  31.18 
 
 		 378 aa  68.2  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  34.11 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  30.83 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  29.41 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  36.78 
 
 		 918 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  35.82 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  26.45 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  30.89 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  30.89 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  30.89 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  32.68 
 
 		 162 aa  42  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>