15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1676 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2555  hypothetical protein  81.84 
 
 		 1310 aa  1836    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1676  hypothetical protein  100 
 
 		 1460 aa  2997    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0665  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1104 aa  350  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3604  hypothetical protein  28.2 
 
 		 941 aa  140  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000975127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1047  hypothetical protein  24.94 
 
 		 925 aa  136  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3160  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1141 aa  104  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5243  hypothetical protein  21.87 
 
 		 1081 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00071392  hitchhiker  0.0000000387225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  26.96 
 
 		 2262 aa  62  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.61 
 
 		 2713 aa  54.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  26.3 
 
 		 6497 aa  54.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1064 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.15 
 
 		 2402 aa  50.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  25 
 
 		 1483 aa  48.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  22.39 
 
 		 5298 aa  46.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  24.45 
 
 		 759 aa  45.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>