More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1032 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2529  elongation factor G  65.64 
 
 		 689 aa  873    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  46.33 
 
 		 691 aa  659    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1032  elongation factor G  65.15 
 
 		 688 aa  893    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.53 
 
 		 700 aa  637    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  57.7 
 
 		 691 aa  783    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  48.34 
 
 		 688 aa  646    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2521  elongation factor G  65.05 
 
 		 688 aa  884    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000125334  normal  0.212921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  46.33 
 
 		 692 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1032  elongation factor G  100 
 
 		 703 aa  1415    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  46.11 
 
 		 697 aa  635    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2171  elongation factor G  70.51 
 
 		 684 aa  960    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  45.52 
 
 		 697 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  46.94 
 
 		 689 aa  646    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  47.68 
 
 		 706 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  46.72 
 
 		 700 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  45.59 
 
 		 691 aa  633  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  45.44 
 
 		 692 aa  635  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  45.52 
 
 		 700 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  45.52 
 
 		 699 aa  630  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  45.52 
 
 		 699 aa  629  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  45.37 
 
 		 692 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  45.36 
 
 		 697 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  48.02 
 
 		 690 aa  626  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  45.36 
 
 		 697 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  46.42 
 
 		 698 aa  626  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  45.36 
 
 		 697 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  44.09 
 
 		 689 aa  622  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  44.94 
 
 		 692 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  45.56 
 
 		 689 aa  623  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  45.25 
 
 		 704 aa  624  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  46.32 
 
 		 691 aa  622  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  46.38 
 
 		 698 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  45.08 
 
 		 691 aa  625  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  44.66 
 
 		 689 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  43.7 
 
 		 690 aa  624  1e-177  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  46.24 
 
 		 697 aa  624  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  45.12 
 
 		 689 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  45.43 
 
 		 699 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  45.44 
 
 		 705 aa  624  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  46.35 
 
 		 695 aa  624  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.33 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  43.79 
 
 		 692 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  44.62 
 
 		 691 aa  621  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  44.62 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  44.49 
 
 		 692 aa  621  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  45 
 
 		 706 aa  620  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  44.91 
 
 		 697 aa  621  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  44.36 
 
 		 691 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  44.62 
 
 		 691 aa  621  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  44.46 
 
 		 694 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  44.31 
 
 		 694 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  46.39 
 
 		 692 aa  617  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  44.43 
 
 		 689 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  45.36 
 
 		 699 aa  617  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  44.9 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  44.49 
 
 		 705 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  44.68 
 
 		 700 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  45.65 
 
 		 692 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  44.78 
 
 		 699 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  44.78 
 
 		 699 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  44.4 
 
 		 700 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  43.64 
 
 		 692 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  44.77 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  44.09 
 
 		 692 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  45.94 
 
 		 698 aa  610  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  44.13 
 
 		 691 aa  611  1e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  43.5 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  44.36 
 
 		 690 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  44.18 
 
 		 701 aa  608  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  44.4 
 
 		 692 aa  612  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  44.4 
 
 		 700 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  45.23 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  44.27 
 
 		 698 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  44.4 
 
 		 704 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.14 
 
 		 692 aa  610  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  43.09 
 
 		 692 aa  610  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  43.97 
 
 		 701 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  46.19 
 
 		 702 aa  608  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  44.93 
 
 		 691 aa  607  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  43.95 
 
 		 698 aa  606  9.999999999999999e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  44.68 
 
 		 704 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  45.95 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  43.11 
 
 		 693 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  45.21 
 
 		 697 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  46.14 
 
 		 699 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000439347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  46.83 
 
 		 695 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  43.46 
 
 		 703 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  44.27 
 
 		 698 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  43.97 
 
 		 701 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  44.1 
 
 		 697 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  43.97 
 
 		 701 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1612  translation elongation factor G  44.33 
 
 		 715 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  44.25 
 
 		 700 aa  607  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  43.6 
 
 		 691 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  44.97 
 
 		 704 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0161  elongation factor G  43.97 
 
 		 690 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.165931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2261  elongation factor G  44.33 
 
 		 693 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00174872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  43.91 
 
 		 696 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  44.31 
 
 		 690 aa  603  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  43.73 
 
 		 692 aa  605  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>