19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0595 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0595  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0582  hypothetical protein  97.12 
 
 
104 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000451193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0639  hypothetical protein  84.21 
 
 
104 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  66.67 
 
 
104 aa  120  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0694  hypothetical protein  66.67 
 
 
103 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000327351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2461  hypothetical protein  62.38 
 
 
284 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0392  hypothetical protein  59.6 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000101925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  44.74 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  43.42 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0385  hypothetical protein  46.03 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  34.44 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  32.69 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  40.35 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1763  hypothetical protein  42.31 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.303633  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  48.15 
 
 
204 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  37.14 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1155  hypothetical protein  29.9 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0011956  hitchhiker  0.0048484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  43.48 
 
 
105 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  34.33 
 
 
94 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>