More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0556 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0543  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  97.38 
 
 
381 aa  772    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0556  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
381 aa  786    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000759492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2352  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.44 
 
 
381 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2182  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.26 
 
 
380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000233071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.87 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.4 
 
 
380 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 
379 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 
379 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.63 
 
 
379 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  40.27 
 
 
379 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
379 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  40.27 
 
 
379 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  40.27 
 
 
379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  40.27 
 
 
379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  39.84 
 
 
379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.84 
 
 
379 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
379 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
379 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
379 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.33 
 
 
380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.32 
 
 
380 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.53 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 
386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.89 
 
 
379 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.53 
 
 
394 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.53 
 
 
390 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.33 
 
 
376 aa  279  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  42.18 
 
 
390 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
379 aa  277  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  39.3 
 
 
379 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.74 
 
 
390 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.95 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.43 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.66 
 
 
386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
381 aa  272  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
376 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
381 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.58 
 
 
390 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
376 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
376 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 
380 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
376 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
376 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.62 
 
 
390 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
376 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1874  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.8 
 
 
387 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33835  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  39.47 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  39.89 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.65 
 
 
387 aa  268  8e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.42 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  41.49 
 
 
378 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.71414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.18 
 
 
390 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.38 
 
 
390 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.16 
 
 
377 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.97 
 
 
387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.35 
 
 
391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.3 
 
 
380 aa  266  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  39.41 
 
 
379 aa  266  5e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.74 
 
 
391 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  39.08 
 
 
407 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.83 
 
 
381 aa  266  5e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.3 
 
 
390 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 
381 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.721434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4720  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.73 
 
 
381 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.93 
 
 
376 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.11 
 
 
388 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.58 
 
 
377 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.58 
 
 
377 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.62 
 
 
387 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.18 
 
 
387 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.34 
 
 
389 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 
381 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 
381 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  40.9 
 
 
447 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 
381 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.11 
 
 
381 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  37.74 
 
 
389 aa  262  8e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  39.63 
 
 
381 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  39.63 
 
 
381 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  39.63 
 
 
381 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  39.63 
 
 
381 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  39.63 
 
 
381 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_004310  BR0020  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.7 
 
 
382 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  39.63 
 
 
381 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.6 
 
 
382 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.66 
 
 
387 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.81 
 
 
389 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.31 
 
 
377 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.81 
 
 
389 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  39.52 
 
 
379 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.94 
 
 
389 aa  259  7e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.54 
 
 
389 aa  258  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.54 
 
 
389 aa  258  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.78 
 
 
387 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0017  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.43 
 
 
382 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0931  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.62 
 
 
386 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.06 
 
 
389 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0966  acyl-CoA dehydrogenase  39.08 
 
 
387 aa  257  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.72 
 
 
387 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.89 
 
 
390 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>