23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6172 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  490  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  37.45 
 
 		 389 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  34.04 
 
 		 439 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  34.91 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  31.84 
 
 		 405 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  32.09 
 
 		 583 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  34.9 
 
 		 229 aa  92  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  30.63 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  33.68 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4985  hypothetical protein  34.83 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  25.21 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  28.64 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  28.37 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  33.61 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2361  hypothetical protein  31.25 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0463376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  27.51 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0339  hypothetical protein  32.85 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  27.07 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3393  hypothetical protein  36.36 
 
 		 193 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0295  hypothetical protein  30.92 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4353  hypothetical protein  26.42 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  21.67 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10832  hypothetical protein  23.11 
 
 		 270 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>