23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6166 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  289  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  82.03 
 
 
129 aa  194  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  77.97 
 
 
120 aa  177  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  77.12 
 
 
120 aa  174  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  74.17 
 
 
120 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  70.34 
 
 
120 aa  164  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  70.83 
 
 
124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  65.83 
 
 
120 aa  160  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  70 
 
 
124 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  61.11 
 
 
127 aa  154  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  65 
 
 
118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0441  hypothetical protein  43.59 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.64264  normal  0.450906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  31.53 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  28.95 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  27.97 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  34.51 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  30.91 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  31.71 
 
 
192 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  26.05 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  32.74 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  30.19 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  28.69 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>