24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5594 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5594  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.738395  normal  0.042079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  33.07 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  32.97 
 
 		 424 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0205  hypothetical protein  32.89 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  27.49 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  30.32 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  30.32 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  30.32 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  31.23 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  23.29 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  29.28 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  25.88 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  31.56 
 
 		 259 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4023  hypothetical protein  26.89 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  34.78 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  28.69 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  26.63 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  27.97 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  28.74 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  28.74 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  36.3 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  28.74 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  32.74 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  31.3 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>