12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5342 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5342  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2350  phosphoglycerate mutase  49.49 
 
 		 221 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  49 
 
 		 238 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4800  phosphoglycerate mutase  48.57 
 
 		 225 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 220 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  27.63 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 218 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1588  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 224 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>