15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4638 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4638  hypothetical protein  100 
 
 
51 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6782  hypothetical protein  78.79 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3163  putative transposase  71.88 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390311  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  69.7 
 
 
213 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  69.7 
 
 
213 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  69.7 
 
 
228 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  72.41 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0477  putative transposase  49.06 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3733  hypothetical protein  70.37 
 
 
131 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  63.64 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  61.76 
 
 
236 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  60.61 
 
 
262 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  60.61 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  60.61 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  81.82 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>