13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1572 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1572  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  198  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2788  hypothetical protein  56.84 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4436  regulatory protein MerR  48.75 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.465157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4025  hypothetical protein  47.62 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874833  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3588  putative transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0192393  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0262  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.143032  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  39.13 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1857  hypothetical protein  30.43 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000070649  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6430  hypothetical protein  39.77 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  34.72 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  34.83 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00590  hypothetical protein  41.43 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2006  hypothetical protein  27.27 
 
 		 98 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0151829  normal  0.258425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>