25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1210 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 307 aa  604  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  78.01 
 
 		 279 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  50.84 
 
 		 248 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  49.81 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  49.41 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  47.55 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  47.15 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  48.57 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  51.26 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  45.31 
 
 		 272 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  47.5 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  46.77 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  47.08 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  48.33 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  47.08 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  47.08 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  47.45 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  48.32 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  48.21 
 
 		 81 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  22.08 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  24.39 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  37.84 
 
 		 115 aa  45.8  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  45.45 
 
 		 85 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  42.62 
 
 		 106 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>