17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1027 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1027  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  51.64 
 
 
274 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  29.89 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  30.58 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  29.21 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  26.81 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  26.81 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  28.94 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2954  hypothetical protein  28.52 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  29.37 
 
 
252 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  30.41 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  26.79 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  24.62 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  25.63 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0884  hypothetical protein  30.61 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  26.42 
 
 
263 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1929  hypothetical protein  25.27 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>