237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3834 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3834  O-methyltransferase family protein  100 
 
 		 217 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.786829  normal  0.0117824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0883  O-methyltransferase family protein  85.59 
 
 		 220 aa  356  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.602304  normal  0.319704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8417  O-methyltransferase  58.49 
 
 		 216 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0381222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1182  O-methyltransferase family 3  58.67 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06420  predicted O-methyltransferase  54.29 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1827  O-methyltransferase family protein  56.94 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.300206  normal  0.244865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3015  O-methyltransferase family 3  59.78 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2155  O-methyltransferase family 3  54.41 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000364971  hitchhiker  0.00389148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2922  O-methyltransferase family 3  55.12 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2796  O-methyltransferase family protein  52.74 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11244  methyltransferase  51.71 
 
 		 247 aa  180  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00594673  normal  0.0330122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4497  O-methyltransferase family protein  51.47 
 
 		 252 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.307702  normal  0.378313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2516  O-methyltransferase family 3  49.75 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2199  O-methyltransferase family protein  49.51 
 
 		 276 aa  175  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.826434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0711  O-methyltransferase family protein  59.07 
 
 		 195 aa  174  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0980  O-methyltransferase family 3  50.5 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1209  O-methyltransferase family protein  60.9 
 
 		 165 aa  174  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.81955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3995  O-methyltransferase family protein  50.5 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4069  O-methyltransferase family protein  50.5 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4009  O-methyltransferase family protein  50 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00221471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1150  O-methyltransferase family 3  56.22 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111109  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0658  O-methyltransferase family protein  57.51 
 
 		 195 aa  168  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308008  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3892  O-methyltransferase family 3  51.28 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7942  O-methyltransferase family 3  52.4 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1066  O-methyltransferase family 3  45.59 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1856  O-methyltransferase family 3  50.5 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25910  predicted O-methyltransferase  49.53 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.946739  normal  0.495264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1005  O-methyltransferase family 3  51.96 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.966394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11250  predicted O-methyltransferase  47.62 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0810  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1122  O-methyltransferase family 3  46 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.429496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15380  predicted O-methyltransferase  38.92 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4298  O-methyltransferase family protein  35.38 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2512  O-methyltransferase family 3  37.19 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0739211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13360  predicted O-methyltransferase  34.18 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.693653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2965  O-methyltransferase family protein  38.22 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4649  O-methyltransferase family 3  44.19 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64073  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03330  O-methyltransferase, putative  32.29 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5429  O-methyltransferase family protein  34.64 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1677  O-methyltransferase family protein  32.12 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.498636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1933  O-methyltransferase family protein  33.01 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.744837  hitchhiker  0.0000011489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4599  O-methyltransferase family protein  31.53 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1754  O-methyltransferase family protein  35.79 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0986  O-methyltransferase family protein  35.79 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0314  O-methyltransferase family protein  35.79 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0301267  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0388  O-methyltransferase family protein  35.79 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0253  O-methyltransferase family protein  35.79 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119274  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1839  O-methyltransferase family protein  35.79 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1343  O-methyltransferase family protein  35.79 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0333  O-methyltransferase family protein  34.95 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10188  O-methyltransferase  40.62 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.153182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0144  O-methyltransferase family protein  37.02 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0960801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0153  O-methyltransferase family protein  37.02 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3725  O-methyltransferase family protein  37.14 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2166  O-methyltransferase family 3  36.55 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0154  O-methyltransferase family protein  39.19 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.177902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0134  O-methyltransferase family protein  37.02 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.670922  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4674  O-methyltransferase family protein  36.42 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3689  O-methyltransferase family protein  36.42 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3865  O-methyltransferase family 3  36.84 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458489  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0850  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  35.79 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1776  O-methyltransferase  30.6 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0966  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  34.43 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.306907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2421  O-methyltransferase family protein  35.76 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00335218  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37392  predicted protein  35.63 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000419488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3782  O-methyltransferase family 3  35.41 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.955684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5071  O-methyltransferase  30.2 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0193  O-methyltransferase family 3  35.22 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2045  O-methyltransferase, putative  31.15 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48780  hypothetical protein  32.84 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114674  hitchhiker  0.000000463304 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7922  O-methyltransferase family 3  33.67 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2897  O-methyltransferase family 3  33.33 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.262328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5032  O-methyltransferase family protein  33.92 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404122  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3189  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  36.51 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1748  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  35.03 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2832  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  32.73 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0681  putative O-methyltransferase  33.85 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.948643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0473  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  32.74 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14350  predicted O-methyltransferase  36.77 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.272747  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2155  O-methyltransferase family 3  31.5 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261573  normal  0.370065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0793  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  35.26 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0566  hypothetical protein  28.92 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.168905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1264  O-methyltransferase family protein  30.54 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2066  O-methyltransferase  30.05 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000833966  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19410  predicted O-methyltransferase  45 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0183718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1827  O-methyltransferase family protein  29.51 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1652  O-methyltransferase family protein  31.28 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3263  O-methyltransferase family protein  29.44 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0525  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  31.82 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3278  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  36.78 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.507462  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0514  O-methyltransferase family protein  36.49 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2427  O-methyltransferase family protein  29.28 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3031  O-methyltransferase family protein  32.64 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3881  O-methyltransferase family protein  32.14 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.56879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3895  O-methyltransferase family 3  29.32 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2810  O-methyltransferase family 3  37.5 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1151  O-methyltransferase  29.47 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1021  O-methyltransferase  29.47 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01450  predicted O-methyltransferase  34.21 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.580973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>